黑客帝国到底有没有真的人类存在？母体设计师他究竟是人类还是机械人？
有真实的世界的，就是外面的废墟以及锡安，矩阵把人类养起来就是为了能源，由于发现人会产生电能，单个能量很小，但成千上万的人产生的电能是巨大的，但电能也逐步不再需要人类发电，又发现人类新的利用价值，由于电脑不会想象，不会发明创造，所以必须仰仗人类的思想和智慧，之后故意放了几个人类回到现实世界，创造了锡安，并源源不断的把人类带出去，目的是让他们发展并发明创造，然后再派一个救世主混入锡安回收资料盘，再派机器章鱼毁灭锡安，很多年后在放几个人出去再创造一个锡安，周而复始，已经循环了很多次了。如果不知道这一切的开头建议看一下黑客帝国动画版，有一部前传，讲的就是人类如何被机器人打败，如何被机器人奴役变成能源的。
《黑客帝国》中尼欧到底是人类还是电脑程式
尼奥一部分是人，一部分是电脑程式。程序在人的身体上运行。救世主传代码是为了母体获得升级信息，不是要毁灭锡安。锡安留给机器乌贼毁灭即可。导演的意图是说锡安是真实的。不断毁灭和重建锡安的过程是系统维持运行稳定的手段，系统里的特工也都是工具。母体的进化是指矩阵里的程序会在与人类相处的生活中学习人类的情感等，所以程序和人的区别越来越小，但系统为了平衡又不得不不断删除这些升级程序，这就很没意义。而且不断履行毁灭和重建锡安的程序在逻辑上也是无意义的，所以先知冒险令尼奥这个救世主不同，让他被爱驱使以交易的形势保住了锡安，而她自己也着手教育程序流亡者——小女孩，她希望未来能改变，人类和机器能和平相处。因为只有这样双方才都能发展。
尼奥的脑中有无线连网设备，所以他能“看见、控制”现实中的机器设备，但并非说那个现实不现实。尼奥在瞎了后不是也看不见自己的飞船和其他景物吗？
黑客帝国中救世主到底谁？机械智能还是人类？
是尼奥，尼奥是人类，意识在Matrix里。
先知老太太、那个门后的老头都是程序，很有可能是最初的制造者遗留下的自身的智能程序。
电影，黑客帝国，为什么主人公是人类的救世主，在第二部里去要到程序内部，见造物主？
总的说来其实大概意思是，现实世界是电脑人控制的，虚拟世界是电脑人创造的，电脑不是完美的，所以有一部分人意识到虚拟世界的存在逃出了控制，因此母体创造了救世主，其实也是为了进一步控制想推翻机械帝国的反抗军团~之所以有6代救世主，就是因为长年累月经常会有脱离母体控制的人类，他们会组织反抗军，创造救世主有利于母体控制、从而一网打尽反抗军~祭师，包括各种帮助反抗军的只是母体中的一个程序，就是为了引导救世主们的~可以说是误导~可以说其实所有救世主的路走的都一样~而Neo（尼奥）是个特例啊！所以他也造就了史密斯这个特例啊！所以母体最后拿史密斯无能为力只好求助于Neo~
《黑客帝国》里的锡安到底是真实世界还是另一个母体
黑客帝国里面的锡安当然是真实世界了，电影中没有任何情节和相关暗示表明锡安是虚拟的。认为锡安是虚拟的母体的观众，一定是根据尼欧可以操纵乌贼兵还有炸弹的那个情节，但是既然故事的背景是高度发达的电脑文明，为什么就不可以是无线连接之类的设定呢，而且电影的第三部还暗示了尼欧因为曾经进入过“代码之源”，从而他的一部分留在了母体内，所以尼欧在现实世界其实也和机器城是有联系的。这种联系可以通过尼欧眼睛瞎了之后，仍然可以“看到”机器城来证明，因为他不是真正看到而是感觉到的。
还有最重要的一个根据，就是虚拟程度再高、再接近现实的系统，它总要有个实体吧，所谓没有无根之水，就算是多层虚拟，也要有个最终的现实世界，但是电影到了第三部已经明显不是虚无论调。而且在真正的科幻的意境，虚拟现实技术应该是和现实融合的，所以机器城和锡安共存明显是电影的真正结局，也是电影表达的真正意思。
